Phân lập và phát hiện chủng vi khuẩn Myxobacteria ở Việt Nam có khả năng tổng hợp Sesquiterpene tương tự Eremophilene

Date Received: 10-09-2017

Date Accepted: 10-10-2017

Date Published: 06-08-2025

##submissions.doi##: https://doi.org/10.31817/tckhnnvn.2017.15.9.

Views

0

Downloads

0

Issue: Vol. 15 No. 9 (2017)

Section:

KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ

How to Cite:

Thuy, L., Nga, L., & Bach, N. (2025). Phân lập và phát hiện chủng vi khuẩn Myxobacteria ở Việt Nam có khả năng tổng hợp Sesquiterpene tương tự Eremophilene . Vietnam Journal of Agricultural Sciences, 15(9), 1247–1255. https://doi.org/10.31817/tckhnnvn.2017.15.9.

Phân lập và phát hiện chủng vi khuẩn Myxobacteria ở Việt Nam có khả năng tổng hợp Sesquiterpene tương tự Eremophilene

Ly Thi Bich Thuy , Le Thi Thien Nga , Nguyen Duc Bach (*)

  • Tác giả liên hệ: [email protected]

    • Keywords

    16S rRNA, Eremophilene, hợp chất tự nhiên, Myxobacteria, Sesquiterpene

    Abstract


    Sesquiterpene được tìm thấy chủ yếu ở thực vật, nấm và một số động vật không xương sống. Gần đây, sinh tổng tổng hợp sesquiterpene ở một số vi khuẩn thuộc nhóm myxobacteria đã được phát hiện. Myxobacteria là một nhóm vi khuẩn tiềm năng được nhiều nhóm nghiên cứu trên thế giới quan tâm nhằm  khai thác các hợp chất thứ cấp mới ứng dụng trong y dược. Tuy nhiên cho đến nay ở Việt Nam hầu như chưa có nghiên cứu về phân lập và xác định đặc điểm của các vi khuẩn này. Trong nghiên cứu này, bằng cách sử dụng các kỹ thuật phân lập, quan sát mô tả hình thái, đặc điểm sinh lý hóa và so sánh trình tự 16S rRNA, 3 chủng vi khuẩn thuộc nhóm myxobacteria đã được phân lập từ các mẫu đất thu thập ở nhiều địa phương khác nhau ở Việt Nam. Khảo sát khả năng tổng hợp sesquiterpene từ các mẫu vi khuẩn phân lập cho thấy chủng DL1 có khả năng sinh thể quả và tổng hợp một sesquiterpene giống như eremophilene.

    References

    Alexander S., Ly T.B.T., Nils G., Zapp J., Thiel V., Schulz S., Hannemann F., Khatri Y. and Bernhardt R. (2015). Characterization of the gene cluster CYP264B1-geoA from Sorangium cellulosum So ce56: Biosynthesis of (+)-Eremophilene and its hydroxylation. ChemBioChem, 16: 337-344.

    Bártíková H., Hanusová V., Skálová L., Ambroz M. and Bousová I. (2014). Antioxidant, pro-oxidant and other biological activities of sesquiterpenes. Current Topics in Medicinal Chemistry, 14: 2478-2494.

    Gerth K., Pradella S., Perlova O., Beyer S., Müller R. (2003). Myxobacteria: proficient producers of novel natural products with various biological activities-past and future biotechnological aspects with the focus on the genus Sorangium. J Biotechnol, 106(2-3): 233 -53.

    Gram H.C. (1884). “Über die isolierte Färbung der Schizomyceten in Schnitt- und Trockenpräparaten” (in German). Fortschritte der Medizin, 2: 185-189.

    Hyesook H., Chung J., Kim J., Lee J.S., Kwon B.M., Son K.H, and Cho K. (2008). Isolation of Sorangium cellulosum carrying epothilone gene clusters. J. Microbiol. Biotechnol, 18(8): 1416-1422.

    Hyun H., Chung J., Kim J., Lee J.S., Kwon B.M., Son K.H., Cho K. (2008). Isolation of Sorangium cellulosum carrying epothilone gene clusters. J Microbiol Biotechnol, 18(8): 1416-1422.

    Konstantinidis K. T., Tiedje J. M. (2005). Genomic insights that advance the species definition for prokaryotes. Proc. Natl Acad. Sci. USA,

    : 2567-2572.

    Li S.G., Zhao L., Han K., Li P.F., Li Z.F., Hu W., Liu H., Wu Z.H., Li Y.Z. (2013). Diversity of epothilone producers among Sorangium strains in producer-positive soil habitats. Microb Biotechnol, 7(2): 130-141.

    Ly T.B.T., Alexander S., Nguyen D.B., Bernhardt R. (2017). Improvement of a P450-based recombinant E. coli whole-cell system for the production of oxygenated sesquiterpene derivatives. J. Agric. Food Chem, doi: 10.1021/acs.jafc.7b00792.

    Nguyen N.P., Warnow T., Pop M., White B. (2016). A perspective on 16S rRNA operational taxonomic unit clustering using sequence similarity. NPJ Biofilms Microbiomes, 2: 16004.

    Reichenbach H. (1983). A simple method for the purification of myxobacteria. J Microbiol Methods, 1: 77-79.

    Reichenbach H. (1999). The ecology of the myxobacteria. Environ.Microbiol, 1: 15-21.

    Reichenbach H. and Dworkin M. (1986). The myxobacteria. The Prokaryotes 4. Springer,

    Third Edition.

    Schneiker S., Perlova O., Kaiser O., Gerth K., Alici A., Altmeyer M.O., Bartels D., Bekel T., Beyer S., Bode E., Bode H.B., Bolten C.J., Choudhuri J.V., Doss S., Elnakady Y.A., Frank B., Gaigalat L., Goesmann A., Groeger C., Gross F., Jelsbak L., Jelsbak L., Kalinowski J., Kegler C., Knauber T., Konietzny S., Kopp M., Krause L., Krug D., Linke B., Mahmud T., Martinez-Arias R., McHardy A.C., Merai M., Meyer F., Mormann S., Munoz-Dorado J., Perez J., Pradella S., Rachid S., Raddatz G., Rosenau F., Rückert C., Sasse F., Scharfe M., Schuster S.C., Suen G., Treuner-Lange A., Velicer G.J., Vorhölter F.J., Weissman K.J., Welch R.D., Wenzel S.C., Whitworth D.E., Wilhelm S., Wittmann C., Blöcker H., Pühler A. and Müller R. (2007). Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum. Nat Biotech, 25:1281-1289.

    Shimkets L.J., Dworkin M., and Reichenbach H. (2006). The myxobacteria. In The Prokaryotes. E.(eds). New York: Springer, pp. 31-115.

    Wenzel S.C. and Müller R. (2007) Myxobacterial natural product assembly lines: fascinating examples of curious biochemistry. Nat Prod Rep, 24: 1211-1224.

    Wilson K. (2001). Preparation of genomic DNA from bacteria. Curr Protoc Mol Biol, doi: 10.1002/0471142727.mb0204s56.

    Wu Z.H,, Jiang D.M., Li P., Li Y.Z. (2005). Exploring the diversity of myxobacteria in a soil niche by myxobacteria-specific primers and probes. Environ Microbiol, 7(10): 1602-1610.