ĐẶC ĐIỂM CÁC GEN KHÁNG COLISTIN VÀ MỘT SỐ KHÁNG SINH QUAN TRỌNG CỦA VI KHUẨN Escherichia coli PHÂN LẬP TỪ CHẤT THẢI CỦA LỢN VÀ NGƯỜI CHĂN NUÔI TẠI SÓC SƠN, HÀ NỘI

Các tệp bổ sung

Ngày nhận bài: 26-02-2025

Ngày xuất bản: 26-02-2025

DOI: https://doi.org/10.1234/z77jv460

Lượt xem

5

Download

2

Số: Tập 22 Số 11 (2024)

Chuyên mục:

KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ

Cách trích dẫn:

Sơn, Đặng T. T., Nhật, T. T., Thảo, P. T. P., Thủy, N. T. T., Etiene, L., & Mỹ, T. N. (2025). ĐẶC ĐIỂM CÁC GEN KHÁNG COLISTIN VÀ MỘT SỐ KHÁNG SINH QUAN TRỌNG CỦA VI KHUẨN Escherichia coli PHÂN LẬP TỪ CHẤT THẢI CỦA LỢN VÀ NGƯỜI CHĂN NUÔI TẠI SÓC SƠN, HÀ NỘI. Tạp Chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam, 22(11). https://doi.org/10.1234/z77jv460

ĐẶC ĐIỂM CÁC GEN KHÁNG COLISTIN VÀ MỘT SỐ KHÁNG SINH QUAN TRỌNG CỦA VI KHUẨN Escherichia coli PHÂN LẬP TỪ CHẤT THẢI CỦA LỢN VÀ NGƯỜI CHĂN NUÔI TẠI SÓC SƠN, HÀ NỘI

Đặng Thị Thanh Sơn (*) 1, 2, 3, 4 , Trần Thị Nhật 1, 2, 3, 4 , Phan Thị Phương Thảo 1, 2, 3, 4 , Nguyễn Thị Thanh Thủy 1, 2, 3, 4 , Etiene Loire 1, 2, 3, 4 , Trương Nhật Mỹ 1, 2, 3, 4

  • Tác giả liên hệ: thanhsonnivr@gmail.com
  • 1 Viện Thú y
  • 2 Khoa Công nghệ thực phẩm, Học viện Nông nghiệp Việt Nam
  • 3 Tổ chức CIRAD
  • 4 Trung tâm Nghiên cứu Y học Việt Đức (VGCARE)

    • Từ khóa

    E. coli, kháng kháng sinh, gen kháng thuốc, chất thải lợn

    Tóm tắt


    Vi khuẩn mang gen kháng kháng sinh là mối đe doạ đối với sức khoẻ cộng đồng. Kết quả nghiên cứu từ 50 hộ chăn nuôi quy mô nhỏ tại Sóc Sơn - Hà Nội cho thấy tỷ lệ phát hiện E. coli kháng colistin trong chất thải lợn là 72% (36/50 hộ) và mẫu chất thải người chăn nuôi là 16% (8/50 hộ). Giải trình tự toàn bộ hệ gen (WGS) 10 chủng E. coli kháng colistin phân lập từ 5 hộ chăn nuôi (1 chủng phân lập từ người và 1 chủng từ lợn) bằng kỹ thuật Oxford Nanopore Technologies (ONT) cho biết có 38 kiểu gen kháng (14 gen nằm trên chromosome và 31 gen kháng nằm trên plasmids) với 9 nhóm kháng sinh và các chủng mang đồng thời từ 7 đến 22 loại gen kháng, bao gồm Beta-lactams, colistin, tetracycline, sulfonamide, quinolon, phenicol, aminoglycoside, marcolide và trimethoprim. Các gen mcr-1 và/hoặc mcr-3 được phát hiện trong 100% (10/10) chủng E. coli kháng colistin. Kết quả cũng cho biết có 3 chủng phân lập từ lợn và 1 chủng từ người mang đồng thời 2 gen mcr-1 và mcr-3. Nghiên cứu đã phát hiện được 1 chủng E. coli (barcode 60 - PCE 20.1) phân lập từ lợn 1 chủng phân lập từ người (barcode 67- PCE 31.1) được xác định thuộc cùng 1 nhánh và có mối quan hệ gần gũi về mặt di truyền mặc dù thuộc 2 hộ chăn nuôi khác nhau.

    Tài liệu tham khảo

    Barlaam A., Parisi A., Spinelli E., Caruso M., Taranto P. DI. and Normanno G. (2019). Global emergence of colistin-resistant Escherichia coli in food chains and associated food safety implications: a review. J Food Prot. 2019 Aug. 82(8):1440-1448. doi: 10.4315/0362-028X.JFP-19-116.

    Blattner F.R., Plunkett G., Bloch C.A., Perna N.T., Burland V., Riley M., Collado-Vides J., Glasner J.D., Rode C.K., Mayhew G.F., Gregor J., Davis N.W., Kirkpatrick H.A., Goeden M.A., Rose D.J., Mau B. & Shao Y. (1997). The complete genome sequence of Escherichia coli K-12.

    Science. 277(5331):1453-62. doi: 10.1126/science.277.5331.1453.

    Borowiak M., Fischer J., Hammerl J.A., Hendriksen R.S., Szabo I., Malorny B. (2017). Identification of a novel transposon-associated phosphoethanolamine transferase gene, mcr-5, conferring colistin resistance in d-tartrate fermenting Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B, J Antimicrob Chemother. 72(12):3317-3324. doi: 10.1093/jac/dkx327.

    Breijyeh Z., Jubeh B. & Karaman R. (2020). Resistance of gram-negative bacteria to current antibacterial agents and approaches to resolve it. Molecules: 25(6): 1340. doi.org/10.3390/molecules25061340

    CLSI, M100 Performance Standards for Antimicrobial susceptibility testing, 31st edition. (2021). doi: 10.1007/978-3-662-48986-4_300418.

    Dang P.K. Saegerman C., Douny C., Ton V.D., Bo H.X., Binh D.V., Ngan P.H. & Scippo M.L. (2013). First survey on the use of antibiotics in pig and poultry production in the Red River Delta region of Vietnam. Food and Public Health. 3(5): 247-256. doi:10.5923/j.fph.20130305.03.

    Duong T.Q.T, Hounmanou Y.M.G., Son T.T.D., Olsen J.E., Giang T.H.T., Nhat T.T., Scheutz F. & Dalsgaard A. (2021). Genetic comparison of esbl-producing Escherichia coli from workers and pigs at vietnamese pig farms, Antibiotics (Basel). 25;10(10):1165. doi: 10.3390/antibiotics10101165.

    Falagas ME, Kasiakou SK. Colistin: the revival of polymyxins for the management of multidrug-resistant gram-negative bacterial infections. Clin Infect Dis 2005;40:1333-41.

    Hinenoya A., Ha N.C., Ngu N.T., Yamasaki S., Hassan J., Awasthi S.P., Phuong H.H., Suong T.T., Duy L.N.D, Yamamoto Y. & Sumimura Y. (2018). Isolation and molecular characterization of extended-spectrum β-lactamase producing Escherichia coli from industrial food animals in Mekong Delta, Vietnam, Japanese journal of veterinary research. 66(1): 1-12, doi: 10.14943/jjvr.66.1.1

    Hounmanou Y.M.G. Bortolaia V., Son D.T.T., Duong T.Q., Olsen J.E. & Dalsgaard A. (2021). ESBL and AmpC β-lactamase encoding genes in E. coli from pig and pig farm workers in Vietnam and their association with mobile genetic elements. Front Microbiol. 11:12:629139. doi: 10.3389/fmicb.2021.629139.

    Kallau N.H.G., Wibawan I.W.T., Lukman D.W. & Sudarwanto M.B. (2018). Detection of multi-drug resistant (MDR) Escherichia coli and tet gene prevalence at a pig farm in Kupang, Indonesia, J Adv Vet Anim Res. 5(4): 388-396. doi: 10.5455/javar.2018.e289.

    Kawahara R., Diep T.K., Ha V.L., Quang N.P., Thang N.N., Yamaguchi T., Kumeda Y. & Yamamoto Y. (2019). Prevalence of mcr- 1 among cefotaxime-resistant commensal Escherichia coli in residents of Vietnam, Infect Drug Resist. 23:12:3317-3325. doi: 10.2147/IDR.S224545.

    Kim S., Woo J.H., Kim N., Kim M.H., Kim S.Y., Son J.H., Moon D.C., Lim S.K., Shin M. & Lee J.C. (2019). Characterization of chromosome-mediated colistin resistance in Escherichia coli isolates from livestock in Korea, Infect Drug Resist; 12: 3291–3299. doi: 10.2147/IDR.S225383.

    Liu YY, Wang Y, Walsh TR, Yi LX, Zhang R, Spencer J, Doi Y, Tian G, Dong B, Huang X, Yu LF, Gu D, Ren H, Chen X, Lv L, He D, Zhou H, Liang Z, Liu JH, Shen J., (2016). Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism MCR-1 in animals and human beings in China: a microbiological and molecular biological study. Lancet Infect Dis. 2016 Feb;16(2):161-8.

    Luo Q., Wang Y. & Xiao Y. (2020). Prevalence and transmission of mobilized colistin resistance (mcr) gene in bacteria common to animals and humans. Biosafety and Health: 2(2): 71-78. doi.org/10.1016/j.bsheal.2020.05.001.

    Lê Thị Nga, Hoàng Hoài Phương, Bùi Thị Kiều Anh, Lê Thị Hiên, Ngô Thanh Phong, Trần Nguyễn Minh Đoan, Huỳnh Thị Kim Phấn, Lê Thị Hảo, (2021). Tỷ lệ vi khuẩn Escherichia coli có mang gen đề kháng colistin phân lập từ thịt heo và người bán thịt heo sống tại Thành phố Hồ Chí Minh. Tạp chí y học dự phòng. 31(7): 25-32. doi.org/10.51403/0868-2836/2021/395

    Nguyen D.P., Nguyen T., Le T.H., Tran N., Ngo T.P., Dang V., Kawai T., Kanki, M., Kawahara R., Jinnai M., Yonogi S., Hirai Y., Yamamoto Y. and Kumeda Y. (2016). Dissemination of extended-spectrum β-lactamase-and AmpC β-lactamase-producing Escherichia coli within the food distribution system of Ho Chi Minh City, Vietnam, BioMed Res. Int., 9. doi: 10.1155/2016/8182096

    Son D.T.T, Duong T.T.Q., Olsen J.E., Nhat T.T., Giang T.H.T, Hue T.K.V & Dalsgaard A. (2021). Research note: Occurrence of mcr- encoded colistin resistance in Escherichia coli from pigs and pig farm workers in Vietnam, FEMS Microbes. 1(1). doi.org/10.1093/femsmc/xtaa003

    Tada T., Nhung P.H., Shimada K., Tsuchiya M., Phuong D.M., Anh N.Q., Ohmagari N. & Kirikae T. (2017). Emergence of colistin-resistant Escherichia coli clinical isolates harboring mcr-1 in Vietnam, Int. J. Infect. Dis. 63: 72-73. doi: 10.1016/j.ijid.2017.07.003.

    Trung N.V., Matamoros S., Carrique-Mas J.J., Nghia N.H., Nhung N.T., Chieu T.T.B., Mai H.H., van Rooijen W., Campbell J., Wagenaar J.A., Hardon A., Mai N.T.N., Hieu T.Q., Thwaites G., de Jong M.D., Schultsz C. & Hoa N.T. (2017). Zoonotic Transmission of mcr-1 colistin resistance gene from small-scale poultry farms, Vietnam, Emerg Infect Dis. 23(3): 529-532. doi: 10.3201/eid2303.161553.

    Trương Thị Quý Dương, Trần Thị Nhật, Trương Thị Hương Giang, John Elmerdahl Olsen, Mahuton Gildas Hounmanou, Anders Dalsgaard, Đặng Thị Thanh Sơn (2021). Kết quả nghiên cứu kiểu hình và kiểu gen kháng kháng sinh của vi khuẩn E. coli sản sinh ESBL phân lập từ chất thải lợn. Tạp chí khoa học kỹ thuật thú y. 28(2).

    Tuo H., Yang Y., Tao X., Liu D., Li Y., Xie X., Li P., Gu J., Kong L., Xiang R., Lei C., Wang H. & Zhang A. (2018). The prevalence of colistin resistant strains and antibiotic resistance gene profiles in Funan river, China. Front Microbiol.

    : 3094. doi: 10.3389/fmicb.2018.03094.

    Ueda S., Ngan B.T.K, Huong B.T.T, Hirai I., Tuyen L., Yamamoto Y. (2015). Limited transmission of blaCTX-M-9-type-positive Escherichia coli between humans and poultry in Vietnam, Antimicrobial agents and chemotherapy. 59: 3574-3577. doi:10.1128/AAC.00517-15.

    Yamaguchi T., Kawahara R., Hamamoto K., Hirai I., Khong D. T., Nguyen T. N., Tran H., Motooka D., Nakamura S. & Yamamoto Y. (2020). High prevalence of colistin-resistant Escherichia coli with chromosomally carried mcr-1 in healthy

    residents in Vietnam, mSphere: 5(2). doi.org/10.1128/msphere.00117-20