Ngày nhận bài: 03-04-2026
Ngày duyệt đăng: 09-06-2026
Ngày xuất bản: 26-10-2026
Lượt xem
Download
Chuyên mục:
Cách trích dẫn:
HOÀN THIỆN PHƯƠNG PHÁP CÔ ĐẶC VIRUS DỊCH TẢ LỢN CHÂU PHI BẰNG POLYETHYLENE GLYCOL NHẰM NÂNG CAO KHẢ NĂNG PHÁT HIỆN TRONG NƯỚC THẢI CHĂN NUÔI
Từ khóa
ASFV, polyethylene glycol, real-time PCR, nước thải chăn nuôi, cô đặc virus
Tóm tắt
Dịch tả lợn châu Phi (African swine fever - ASF) là bệnh truyền nhiễm nguy hiểm với tỷ lệ tử vong lên đến 100%. Virus ASF (ASFV) có khả năng tồn tại trong môi trường nước thải chăn nuôi, tuy nhiên tải lượng virus thường thấp và chịu ảnh hưởng của các chất ức chế PCR, gây khó khăn cho việc phát hiện. Nghiên cứu này nhằm hoàn thiện quy trình cô đặc ASFV bằng polyethylene glycol (PEG) trước khi tách chiết DNA, góp phần nâng cao hiệu quả phát hiện bằng phương pháp real-time PCR. Kết quả cho thấy các điều kiện xử lý mẫu phù hợp bao gồm thể tích mẫu 15ml, tiền ly tâm ở 2.000g/10 phút và sử dụng phần dịch nổi cho bước cô đặc. Nồng độ PEG 6000 tối ưu là 15% (w/v) và ly tâm sa lắng virus ở 10.000g/30 phút. Hai phương pháp tách chiết DNA cho hiệu quả tương đương. Áp dụng quy trình xử lý mẫu bằng PEG giúp cải thiện rõ rệt khả năng phát hiện ASFV so với mẫu không xử lý. Khi ứng dụng trên mẫu thực địa, số mẫu dương tính tăng từ 1/56 (không xử lý) lên 8/56 (có xử lý). Kết quả cho thấy quy trình cô đặc bằng PEG có tiềm năng ứng dụng trong giám sát môi trường và hỗ trợ phát hiện sớm ASFV trong chăn nuôi.
Tài liệu tham khảo
Ahmed W., Simpson S. L., Bertsch P. M., Bibby K., Bivins A., Blackall L.L., Bofill-Mas S., Bosch A., Brandão J. & Choi P.M. (2022). Minimizing errors in RT-PCR detection and quantification of SARS-CoV-2 RNA for wastewater surveillance. Science of The Total Environment. 805: 149877.
Amdiouni H., Maunula L., Hajjami K., Faouzi A., Soukri A. & Nourlil J. (2012). Recovery comparison of two virus concentration methods from wastewater using cell culture and real-time PCR. Curr Microbiol. 65(4): 432-7.
Davies K., Goatley L.C., Guinat C., Netherton C. L., Gubbins S., Dixon L.K. & Reis A.L. (2017). Survival of African Swine Fever Virus in Excretions from Pigs Experimentally Infected with the Georgia 2007/1 Isolate. Transbound Emerg Dis. 64(2): 425-431.
Dixon L.K., Chapman D. a. G., Netherton C.L. & Upton C. (2013). African swine fever virus replication and genomics. Virus Res. 173(1): 3-14.
Farkas K., Hillary L.S., Thorpe J., Walker D.I., Lowther J.A., McDonald J.E., Malham S.K. & Jones D.L. (2021). Concentration and quantification of SARS-CoV-2 RNA in wastewater using polyethylene glycol-based concentration and qRT-PCR. Methods and protocols. 4(01): 17.
Farkas K., McDonald J.E., Malham S.K. & Jones D.L. (2018). Two-Step Concentration of Complex Water Samples for the Detection of Viruses. Methods Protoc. 1(3).
Farkas K., Pellett C., Alex-Sanders N., Bridgman Matthew T.P., Corbishley A., Grimsley Jasmine M.S., Kasprzyk-Hordern B., Kevill Jessica L., Pântea I., Richardson-O’neill India S., Lambert-Slosarska K., Woodhall N. & Jones Davey L. (2022). Comparative Assessment of Filtration- and Precipitation-Based Methods for the Concentration of SARS-CoV-2 and Other Viruses from Wastewater. Microbiology Spectrum. 10(4): e01102-22.
Hjelmsø M.H., Hellmér M., Fernandez-Cassi X., Timoneda N., Lukjancenko O., Seidel M., Elsässer D., Aarestrup F.M., Löfström C., Bofill-Mas S., Abril J.F., Girones R. & Schultz A.C. (2017). Evaluation of Methods for the Concentration and Extraction of Viruses from Sewage in the Context of Metagenomic Sequencing. PLoS One. 12(1): e0170199.
Lê Trần Hoàng Anh, Bùi Lệ Thủy, Đặng Thị Hằng, Trần Thị Mỹ An, Đàm Quốc Khánh & Mai Thị Ngân (2025). Tối ưu phương pháp xử lý mẫu nước bọt để nâng cao độ nhạy trong chẩn đoán bệnh dịch tả lợn châu Phi. Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. 23(1): 27-35.
Le V.P., Jeong D.G., Yoon S.W., Kwon H.M., Trinh T.B.N., Nguyen T.L., Bui T.T.N., Oh J., Kim J.B., Cheong K.M., Van Tuyen N., Bae E., Vu T.T.H., Yeom M., Na W. & Song D. (2019). Outbreak of African Swine Fever, Vietnam. Emerg Infect Dis. 25(7): 1433-1435.
Mailepessov D., Arivalan S., Kong M., Griffiths J., Low S.L., Chen H., Hapuarachchi H.C., Gu X., Lee W.L., Alm E.J., Thompson J., Wuertz S., Gin K., Ng L.C. & Wong J.C.C. (2022). Development of an efficient wastewater testing protocol for high-throughput country-wide SARS-CoV-2 monitoring. Sci Total Environ. 826: 154024.
Montgomery R.E. (1921). On a form of swine fever occurring in British East Africa (Kenya Colony). Journal of comparative pathology and therapeutics. 34: 159-191.
Niederwerder M.C., Stoian A.M.M., Rowland R.R.R., Dritz S.S., Petrovan V., Constance L. A., Gebhardt J.T., Olcha M., Jones C.K., Woodworth J.C., Fang Y., Liang J. & Hefley T.J. (2019). Infectious Dose of African Swine Fever Virus When Consumed Naturally in Liquid or Feed. Emerg Infect Dis. 25(5): 891-897.
Ozawa H., Kitamura K. & Yoshida H. (2025). Optimizing solid-based methods for SARS-CoV-2 detection in wastewater: addressing PCR inhibition and variant challenges. Applied and Environmental Microbiology. 91(8): e00589-25.
Sapula S.A., Whittall J.J., Pandopulos A.J., Gerber C. & Venter H. (2021). An optimized and robust PEG precipitation method for detection of SARS-CoV-2 in wastewater. Science of The Total Environment. 785: 147270.
Tignon M., Gallardo C., Iscaro C., Hutet E., Van Der Stede Y., Kolbasov D., De Mia G.M., Le Potier M.F., Bishop R.P., Arias M. & Koenen F. (2011). Development and inter-laboratory validation study of an improved new real-time PCR assay with internal control for detection and laboratory diagnosis of African swine fever virus. J Virol Methods. 178(1-2): 161-70.
Trần Thị Hà, Trương Hà Thái, Chu Thị Thanh Hương & Lại Thị Lan Hương (2021). Nghiên cứu một số đặc điểm dịch tễ học bệnh dịch tả lợn châu Phi (ASF) tại huyện Quỳnh Phụ, tỉnh Thái Bình. Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. 19(11): 1436-1445.
Wang W., Li R., Chen S., Chen L., Jiang Y., Xiang J., Wu J., Li J., Chen Z. & Wu C. (2025). Wastewater-Based Surveillance of SARS-CoV-2 and Modeling of COVID-19 Infection Trends. Trop Med Infect Dis. 10(9).
Woah (2025). African swine fever (ASF) - Situation Reports 63 [Online]. Retrieved from https://www.woah.org/en/document/african-swine-fever-asf-situation-reports-63/ on Dec 23, 2025.
Yang S., Jiao Y., Dong Q., Li S., Xu C., Liu Y., Sun L. & Huang X. (2024). Evaluating approach uncertainties of quantitative detection of SARS-CoV-2 in wastewater: Concentration, extraction and amplification. Science of The Total Environment. 951: 175285.
Zhang D., Duran S.S.F., Lim W.Y.S., Tan C.K.I., Cheong W.C.D., Suwardi A. & Loh X.J. (2022). SARS-CoV-2 in wastewater: From detection to evaluation. Mater Today Adv. 13: 100211.
Zheng X., Wang M., Deng Y., Xu X., Lin D., Zhang Y., Li S., Ding J., Shi X., Yau C.I., Poon L.L.M. & Zhang T. (2023). A rapid, high-throughput, and sensitive PEG-precipitation method for SARS-CoV-2 wastewater surveillance. Water Res. 230: 119560.