Những thông tin đầy đủ hơn về các vùng di truyền trong hệ gen sẽ là cơ sở cho việc nâng cao hiệu suất sử dụng đạm ở cây trồng. Mục đích của nghiên cứu này nhằm xác định các vùng di truyền trong hệ gen của lúa có liên quan đến hiệu suất sử dụng đạm thông qua việc phân tích QTL đối với các dòng thuần tái tổ hợp (RILs) từ hai dòng bố mẹ Azucena và IR64. 169 RILs và hai dòng bố mẹ được trồng trong cùng điều kiện môi trường trong phytotron với các mức bón đạm khác nhau. Thí nhiệm được lặpp lại hai lần riêng biệt. Phần mềm WinQTL Cartographer version 2.5 được sử dụng trong việc phân tích QTL với từng thí nghiệm riêng biệt. Thí nghiệm thứ nhất xác định được 44 QTL cho 15 tính trạng theo dõi bao gồm: số lá (NL), số nhánh (NT), chiều cao cây (PH), tổng khối lượng chất tươi (FM), khối lượng rễ khô (DWR), khối lượng thân và cuống lá khô (DWS), khối lượng phiến lá khô (DWL), tổng khối lượng chất khô (DM), hàm lượng chlorophyll (CCI), hàm lượng N trong rễ (%NR), hàm lượng N trong thân và cuống lá (%NS), hàm lượng N trong phiến lá (%NL), hiệu suất sử dụng đạm hấp thụ (aNUE), hiệu suất sử dụng đạm sinh lý (pNUE), hiệu suất sử dụng đạm nông học (agNUE). Các QTL này nằm trên các nhiễm sắc thể 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8,10 và12. Thí nghiệm lặp lại thứ 2 xác định được 44 QTL cho các tính trạng: NL, NT, PH, FM, DWR, DWS, DWL, DM,CCI, %NR, %NL, aNUE và agNUE trên các nhiễm sắc thể 1, 2, 3, 5, 6, 7, 8 và 12.